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林关宁

时间:2016-06-16

林关宁,博士,上海交通大学特别研究员,上海高校特聘教授(东方学者),博士生导师。美国贝勒大学(Baylor University)计算机科学学士(2003.06)和硕士学位(2005.06);美国密苏里大学(University of Missouri)信息学博士(2010.12)。2010年底起在美国加州大学圣迭戈分校(University of California, San Diego)医学院从事博士后研究。2016年正式成为上海交通大学特别研究员,从事研究领域是生物医学信息学在复杂型疾病的应用及临床大数据处理和分析。近年来一直致力于精神疾病相关研究,重点集中在利用基因转录组数据等高通量的-OMIC生物数据组,利用网络生物学的方法来了解人类大脑的转录组结构,把有遗传性精神疾病的风险因子,大脑的电路和分子功能,及人类和体内外实验模型系统,有效及系统性关联起来。目标是开发神经系统和精神疾病,包括自闭症和精神分裂症之内的有效疗法。已在Neuron(期刊亮点),Nature CommunicationAmerican Journal of Human GeneticsCell等国际高水平杂志已发表SCI论文。


实验室网址:http://bmi.sjtu.edu.cn/

 

主要研究方向:生物医学信息学,精神疾病遗传信息学,复杂疾病分子机制研究

 

科研项目:主持国家自然科学基金面上、国家重点研发计划子课题、上海市东方学者等



五篇代表性论文

·GN Lin, R Corominas, I Lemmens, X Yang, J Tavernier, DE Hill, M Vidal, J Sebat, LM Iakoucheva.

Spatio-temporal 16p11.2 protein network implicates cortical late mid-fetal brain development and KCTD13-Cul3-RhoA pathway in psychiatric diseases.

Neuron. 2015 Feb 18;85(4):742-54. (Issue Highlight)

(Featured in Scientific American, IFLScience, ScienceDaily, Medical Xpress, San Diego County News, ANI News, Neuroscience news, MedIndia, Sci Guru Science News, Business 2 community, etc.)

·R Corominas#, X Yang#, GN Lin#, S Kang#, Y Shen, SA Wanamaker, S Tam, M Rodriguez, M. Broly, J Sebat, K Salehi-Ashtiani, DE Hill, M Vidal, T Hao and LM Iakoucheva.

Protein interaction network of alternatively-spliced isoforms from brain links genetic risk factors for autism.

Nature Communication, 2014 April 5:3650.

(Featured by UCSD news, Nature Commu, ScienceDaily, neurosciencenews, newswise, etc)

·GN Lin, C Zhang, and D Xu.

Polytomy identification in microbial phylogenetic reconstruction.

BMC System Biology, 2011 Dec 23:5.

·GN Lin, Z Wang, D Xu, and J Cheng.

SeqRate: sequence-based protein folding type classification and rates prediction.

BMC Bioinformatics, 2010 April 29:11.

·GN Lin, Z Cai, G Lin, S Chakraborty, and D Xu.

ComPhy: prokaryotic composite distance phylogenies inferred from whole-genome gene sets.

BMC Bioinformatics, 2009 Jan 30:10.



 

电子邮箱: nickgnlin@sjtu.edu.cn, nickgnlin@smhc.org.cn

办公电话:86-21-62933234


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