• 康亚妮

    博士,高级工程师,硕士生导师,SMC晨星青年学者、卓越奖励计划获得者。主要从事高通量测序与基因检测新技术的研发及应用工作,建立了多种表观基因组、转录组学技术,并将其应用于肿瘤、干细胞、卵巢发育和疾病发生机制的研究。发表学术论文50余篇,发明专利20余项,论著2篇。研究成果获抗癌协会颁发的杰出贡献奖、肿瘤国际会议Travel Award及蒙民伟国际交流基金的资助。负责上海市自然科学基金、转化医学基金、医工交叉研究课题、实验室科技创新课题等科研项目。指导百余名本科生的毕业设计、大创、PRP、科创实践等项目50多项,获多项科技创新竞赛奖。中国生物工程学会系统生物医学专业委员会、中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会会员。



研究方向

1.基因检测与高通量测序新技术的研发;

2.甲基化标志物的研究及其在液体活检中的应用;

3.疾病发生发展的表观基因组和转录调控机制。


科研项目

项目来源/类型

课题名称

角色

上海市自然科学基金 技术探索类项目

血浆cfDNA全局性甲基化检测技术的研发及应用

负责

转化医学国家重大科技基础设施开放课题

肿瘤血浆cfDNA全基因组甲基化检测技术的研发及应用

上海交通大学决策咨询课题实验技术专项

一种高分辨率的全基因组范围APA位点定位分析方法的研究

上海交通大学决策咨询课题实验技术专项

肿瘤血浆cfDNA全基因组甲基化检测技术

上海交通大学实验室创新研究项目

基于高通量测序的全基因组范围分析APA的技术研发

SMC-晨星优秀青年学者奖励计划

胃癌发生发展的表观遗传调控机制

校企合作项目横向课题

胰腺癌病人血液cfDNA甲基化谱分析

“交大之星”医工交叉研究基金

microRNA-21调控肺癌细胞上皮-间质转化与转移潜能的研究

合作方

负责人

“交大之星”医工交叉研究基金

食道通结方联合化疗治疗食管癌的血液脂质代谢组学研究

“交大之星”医工交叉研究基金

Hh-ABCG2信号通路促进胃癌化疗耐药的作用机制研究

医工交叉研究基金

基于3T-seq的复发胶质瘤选择性多聚腺苷酸化(APA)位点的研究

医工交叉研究基金

神经胶质瘤间充质型肿瘤干细胞放疗抵抗的分子机制

国家自然科学基金面上项目

MOV10蛋白抑制逆转录转座子LINE-1转座的机理研究

国家自然科学基金面上项目

水杨酸和茉莉酸甲酯对高温胁迫龙须菜的作用及其机理研究

医工交叉项目已结题5项(结项评价2项优秀、3项良好),合作经验较丰富

如对相关研究方向感兴趣,欢迎交流、合作,共同开展医工交叉、校企合作等项目。

代表性论文专著

1. Gao QH, Wen B, Kang Y*, Zhang WM*. Pump-free microfluidic magnetic levitation approach for density-based cell characterization. Biosens Bioelectron. 2022 May 15; 204:114052. 
2. Zhao H, Zhang H, Xu W, Wen B, Kang Y*. A Sight of the Diagnostic Value of Aberrant Cell-Free DNA Methylation in Lung Cancer. Dis Markers. 2022 Jan 27;2022:9619357. 
3. Yu B, Zhu N, Fan Z, Li J, Kang Y*, Liu B*. miR-29c inhibits metastasis of gastric cancer cells by targeting VEGFA. J Cancer. 2022 Otc 31; 13(14):3566-3574. 
4. Wang J#,  Qin Y#, Kang Y#, Li X, Wang Y,  Li H*, Daniel M.C*, Shao Z*. Temporal profiling with ultra-deep RRBS sequencing reveals the relative rarity of stably maintained methylated CpG sites in human cells. Acta Biochim Biophys Sin 2022, 54(12):1-4. 
5. Mao Z, Li T, Zhao H, Wang X, Kang Y, Kang Y*. Methylome and transcriptome profiling revealed epigenetic silencing of LPCAT1 and PCYT1A associated with lipidome alterations in polycystic ovary syndrome. J Cell Physiol. 2021;236:6362-6375. 
6. Mao Z, Li T, Zhao H, Qin Y, Wang X, Kang Y*. Identification of epigenetic interactions between microRNA and DNA methylation associated with polycystic ovarian syndrome. J Hum Genet. 2021,66(2):123-137.  
7. Qin Y, Li T, Zhao H, Mao Z, Ding C, Kang Y*. Integrated Transcriptomic and Epigenetic Study of PCOS: Impact of Map3k1 and Map1lc3a Promoter Methylation on Autophagy. Front. Genet. 2021,12:620241.
8. Qin Y, Wang Y, Zhao H, Yang Z, Kang Y*. Aberrant miRNA-mRNA regulatory network in polycystic ovary syndrome is associated with markers of insulin sensitivity and inflammation. Ann Transl Med.2021;9(18):1405.
9. Mao Z, Zhao H, Qin Y, Wei J, Sun J, Zhang W, Kang Y*. Post-Transcriptional Dysregulation of microRNA and Alternative Polyadenylation in Colorectal Cancer. Frontiers in Genetics. 2020, 11:64.
10.Wei J , Gao X, Qin Y, Liu T, Kang Y*. An iron metabolism-related SLC22A17 for the prognostic value of gastric cancer. OncoTargets and Therapy, 2020:13 12763-75.

* 表示通讯作者;#表示共同一作



教学工作

课程:本科生毕业设计(论文);生物医学工程专业实习;分子病理学


研究生培养/招生专业:生物学、生物与医药、生物医学工程


软件版权登记及专利

授权发明专利:

1. 一种用于肺癌预后诊断标志物的应用及检测试剂盒,授权专利号:CN 113151462 B

2. 诊断结直肠癌的分子组合标志物及检测试剂盒,授权专利号:CN110241211B

3. 一种从卵泡液中提取cfDNA的方法,授权专利号:CN110144345B

4. 一种微量DNA样品高通量测序文库的构建技术,授权专利号:CN 109023537 B

5. 一种用于DNA甲基化检测的试剂盒与方法及应用,授权专利号:CN108796039B

6. 一种检测蛋白质和DNA相互作用的试剂盒与方法及应用,授权专利号:CN108680757B

7. 红藻龙须菜多糖及其制备、抗肿瘤活性检测方法和应用,授权专利号:CN105542024B

8. 基于3T-seq全基因组范围分析APA的方法,授权专利号:CN103911449B

9.DNA甲基化标志物LPCAT1在制备诊断PCOS试剂盒中的应用,公布号:CN111254192A

10.用于PCOS诊断的颗粒细胞生物标志物及其筛选方法和诊断试剂盒,公布号:CN110747269A

荣誉奖励

国际肿瘤会议优秀海报奖(Outstanding Contribution and Poster Award)

上海交通大学卓越奖励计划

上海交通大学SMC晨星青年学者优秀教师奖励计划

上海交通大学实验室安全与环保督导专家

上海交通大学优秀班主任
中国生物工程学会 系统生物医学专业委员会会员
中国抗癌协会 肿瘤标志专业委员会会员


指导学生科创竞赛获奖

国家级大学生生命科学创新竞赛 二等奖

上海市大学生生命科学创新竞赛 一等奖

上海交通大学大学生生命科学创新竞赛 获奖7

上海交通大学“钱学森杯”科创竞赛 获奖5

生物医学工程学院首届毕业设计作品展 一等奖


联系方式

邮箱地址:kangyani@sjtu.edu.cn

办公地址:闵行校区文选医学楼126