• 康亚妮

    博士,高级工程师,硕士生导师,晨星青年学者、卓越奖励计划获得者。主要从事基因检测与疾病诊断新技术的研发及应用工作,建立了多种基于高通量测序的表观基因组、转录组学技术,并将其应用于肿瘤、干细胞、卵巢疾病的检测及其发生机制的研究。发表学术论文50余篇,发明专利20余项,论著2篇。研究成果获抗癌协会颁发的杰出贡献奖、肿瘤国际会议Travel Award及蒙民伟国际交流基金的资助。负责上海市自然科学基金、转化医学基金、医工交叉研究课题、实验室科技创新课题等科研项目。指导百余名本科生的毕业设计、大创、PRP、科创实践等项目50多项,获多项科技创新竞赛奖。中国生物工程学会系统生物医学专业委员会、中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会会员。



研究方向


1.   基因检测与高通量测序新技术的研发

2.   肿瘤液体活检及甲基化诊断试剂盒的开发

3.   疾病发生发展的表观基因组和转录调控机制

4.   DNA甲基化与衰老标志物:表观遗传时钟

5.   单细胞甲基化保真度的研究



科研项目

项目来源/类型

课题名称

角色

上海市自然科学基金 技术探索类项目

血浆cfDNA全局性甲基化检测技术的研发及应用

负责

转化医学国家重大科技基础设施开放课题

肿瘤血浆cfDNA全基因组甲基化检测技术的研发及应用

上海交通大学决策咨询课题实验技术专项

一种高分辨率的全基因组范围APA位点定位分析方法的研究

上海交通大学决策咨询课题实验技术专项

肿瘤血浆cfDNA全基因组甲基化检测技术

上海交通大学实验室创新研究项目

基于高通量测序的全基因组范围分析APA的技术研发

SMC-晨星优秀青年学者奖励计划

胃癌发生发展的表观遗传调控机制

产学研校企合作项目

胰腺癌病人血液cfDNA甲基化谱分析

“交大之星”医工交叉研究基金

microRNA-21调控肺癌细胞上皮-间质转化与转移潜能的研究

合作方

负责人

“交大之星”医工交叉研究基金

食道通结方联合化疗治疗食管癌的血液脂质代谢组学研究

“交大之星”医工交叉研究基金

Hh-ABCG2信号通路促进胃癌化疗耐药的作用机制研究

医工交叉研究基金

基于3T-seq的复发胶质瘤选择性多聚腺苷酸化(APA)位点的研究

医工交叉研究基金

神经胶质瘤间充质型肿瘤干细胞放疗抵抗的分子机制

国家自然科学基金面上项目

MOV10蛋白抑制逆转录转座子LINE-1转座的机理研究

国家自然科学基金面上项目

水杨酸和茉莉酸甲酯对高温胁迫龙须菜的作用及其机理研究

医工交叉项目已结题5项(结项评价2项优秀、3项良好),合作经验较丰富

如对相关研究方向感兴趣,欢迎交流、合作,共同开展医工交叉、校企合作等项目。

代表性论文专著


1.     He M, Zhang H, Zhang Y, Ding Y, Zhang F, Kang Y*. Systematic Analysis to Identify the MIR99AHG-has-miR-21-5p-EHD1 CeRNA Regulatory Network as Potential Biomarkers in Lung Cancer. J Cancer. 2024 Mar 4;15(8):2391-2402.

2.     Zhang F, Ding Y, Zhang B, He M, Wang Z, Lu C, Kang Y*. Analysis of Methylome, Transcriptome, and Lipid Metabolites to Understand the Molecular Abnormalities in Polycystic Ovary Syndrome. Diabetes Metab Syndr Obes. 2023 Sep 11;16:2745-2763.

3.     Gao QH, Wen B, Kang Y*, Zhang WM*. Pump-free microfluidic magnetic levitation approach for density-based cell characterization. Biosens Bioelectron. 2022 May 15; 204:114052. 

4.     Zhao H, Zhang H, Xu W, Wen B, Kang Y*. A Sight of the Diagnostic Value of Aberrant Cell-Free DNA Methylation in Lung Cancer. Dis Markers. 2022 Jan 27;2022:9619357. 

5.     Yu B, Zhu N, Fan Z, Li J, Kang Y*, Liu B*. miR-29c inhibits metastasis of gastric cancer cells by targeting VEGFA. J Cancer. 2022 Otc 31; 13(14):3566-3574. 

6.     Mao Z, Li T, Zhao H, Wang X, Kang Y, Kang Y*. Methylome and transcriptome profiling revealed epigenetic silencing of LPCAT1 and PCYT1A associated with lipidome alterations in polycystic ovary syndrome. J Cell Physiol. 2021;236:6362-6375. 

7.     Mao Z, Li T, Zhao H, Qin Y, Wang X, Kang Y*. Identification of epigenetic interactions between microRNA and DNA methylation associated with polycystic ovarian syndrome. J Hum Genet. 2021,66(2):123-137.  

8.     Qin Y, Li T, Zhao H, Mao Z, Ding C, Kang Y*. Integrated Transcriptomic and Epigenetic Study of PCOS: Impact of Map3k1 and Map1lc3a Promoter Methylation on Autophagy. Front. Genet. 2021,12:620241.

9.     Qin Y, Wang Y, Zhao H, Yang Z, Kang Y*. Aberrant miRNA-mRNA regulatory network in polycystic ovary syndrome is associated with markers of insulin sensitivity and inflammation. Ann Transl Med.2021;9(18):1405.

10.  Mao Z, Zhao H, Qin Y, Wei J, Sun J, Zhang W, Kang Y*. Post-Transcriptional Dysregulation of microRNA and Alternative Polyadenylation in Colorectal Cancer. Frontiers in Genetics. 2020, 11:64.

11.  Wei J , Gao X, Qin Y, Liu T, Kang Y*. An iron metabolism-related SLC22A17 for the prognostic value of gastric cancer. OncoTargets and Therapy, 2020:13 12763-75.

12.  Kang Y, Ooi HS, Zhao X. Transcript Profiling Analysis Through Paired-End Ditag (PET) Approach Coupled with Deep Sequencing Reveals Transcriptome Complexity in Yeast. Methods Mol Biol. 2019;2049:105-112.

13.  Xu W, Lu J, Zhao Q, Wu J, Sun J, Han B, Zhao X, Kang Y*. Genome-Wide Plasma Cell-Free DNA Methylation Profiling Identifies Potential Biomarkers for Lung Cancer. Dis Markers. 2019 Feb 5;2019:4108474.

14.  Yang X, Wu J, Xu W, Tan S, Chen C, Wang X, Sun J, Kang Y*. Genome-wide profiling reveals cancer-related genes with switched alternative polyadenylation sites in colorectal cancer. Onco Targets Ther. 2018 Aug 31;11:5349-5357.

15.  Kang Y, Wang ZJ, Xie D, Sun X, Yang W, Zhao X, Xu N. Characterization and Potential Antitumor Activity of Polysaccharide from Gracilariopsis lemaneiformis. Mar Drugs. 2017 Mar 29;15(4):100.


教学工作

课程:

生物医学工程专业本科生毕业设计(论文);生物医学工程专业科创实习;分子病理学

高中生科创营、夏令营、冬令营科创讲座、课题探究、竞赛指导


研究生培养/招生专业:

生物学、生物与医药、生物医学工程(欢迎咨询、报考)

软件版权登记及专利

授权发明专利:

专利名称

授权专利号

授权日期

发明人

一种用于肺癌预后诊断标志物的应用及检测试剂盒

CN113151462B

2023.3.21

康亚妮,何梦菊,张浩然,张辉,徐菡佳,丁羽殷

诊断结直肠癌的分子组合标志物及检测试剂盒

CN110241211B

2023.3.28

康亚妮毛湛睿孙洁林张辉赵晖

一种可传代细胞的高保真甲基化位点的分离与分析方法

CN115651973B

2023.9.29

康亚妮程酩王佳宁邵志峰李华秦玉兰

一种精准分析单细胞APA位点的sc3T-seq方法

CN116083531B

2023.5.9

康亚妮文柏清张伟伟张飞何梦菊张博涵

一种用于生物大组织X射线3D高分辨率成像的标记方法

CN116106540B

2023.5.12

邵志峰文柏清张倪闫方李小卫孙洁林康亚妮程酩

一种从卵泡液中提取cfDNA的方法

CN110144345B

2022.7.15

康亚妮,秦玉兰,毛湛睿,赵晖

一种检测蛋白质和DNA相互作用的试剂盒与方法及应用

CN108680757B

2021.2.9

康亚妮,赵小东,徐伟,毛湛睿

一种用于DNA甲基化检测的试剂盒与方法及应用

CN108796039B

2021.10.8

康亚妮,赵小东,邵志峰,毛湛睿,金戈旋

一种微量DNA样品高通量测序文库的构建技术

CN109023537B

2021.10.8

赵小东,康亚妮,胡丛霞,徐伟

红藻龙须菜多糖及其制备、抗肿瘤活性检测方法和应用

CN105542024B

2018.11.20

康亚妮,赵小东,邵志峰

基于3T-seq全基因组范围分析APA的方法

CN103911449B

2015.08.12

赵小东,邵志峰,康亚妮,赖登攀,吴俊

荣誉奖励

国际肿瘤会议优秀海报奖(Outstanding Contribution and Poster Award)

上海交通大学卓越奖励计划

上海交通大学SMC晨星青年学者优秀教师奖励计划

上海交通大学实验室安全与环保督导专家

上海交通大学优秀班主任
中国生物工程学会 系统生物医学专业委员会会员
中国抗癌协会 肿瘤标志专业委员会会员


指导学生科创竞赛获奖

国家级大学生生命科学创新竞赛 二等奖

上海市大学生生命科学创新竞赛 一等奖

上海交通大学大学生生命科学创新竞赛 获奖7

上海交通大学“钱学森杯”科创竞赛 获奖5

生物医学工程学院首届毕业设计作品展 一等奖

指导中学生、小学生科创课题及竞赛项目多项

联系方式

邮箱地址:kangyani@sjtu.edu.cn

办公地址:闵行校区文选医学楼126