• 宋萍

    长聘教轨副教授,博士生导师,国家级高级人才项目上海市海外高层次人才。博士毕业于中国科学院上海应用物理研究所,之后前往美国莱斯大学从事多年博士后和高级研究科学家的工作,与此期间兼职在NuProbe Inc (USA) 一家全球基因诊断公司担任多个大型研发课题的负责人。主要研究领域包括1)可编程核酸探针的设计及在癌症精准诊断中的应用;2)基因组和转录组的新技术开发及在癌症早期诊断和术后监测的应用;3)DNA数据存储。以第一作者身份发表文章包括Nature Biomedical Engineering (x2), Nature Communications,Nature Protocols,Nano Letters 等。申请并获批多项中国、美国以及国际专利,实现多项科研成果产业化。主持和负责基金包括国家自然科学基金面上项目,科技部重点研发项目等。担任多个著名期刊的编辑并担任Journal of Functional Biomaterials 的客座副主编。

工作经历

2016年7月-2017年7月 美国莱斯大学 博士后

2017年8月-2021年  美国莱斯大学 高级研究科学家

2019年1月-2021年  NuProbe Inc (USA) 高级研究科学家 (兼职)

2021年 -至今 上海交通大学生物医学工程学院

科研项目


  1. 国家自然科学基金委员会, 面上项目,  2022-01-01 至 2025-12-31, 60万元, 主持
  2. 科技部重点研发项目 2021.12 - 2024. 11 ,3000万(共),课题骨干


代表性论文专著

1. Ping SongSherry X. Chen … David Yu Zhang*, Detection and quantitation of low fraction DNA variants via low-depth sequencing using multiplexed allele enrichment, Nature Biomedical Engineering, 2021, 5, 690-701.

2. Ping Song1Lucia R. Wu1 … David Yu Zhang*, Limitations and opportunities of technologies for the analysis of cell-free DNA in cancer diagnosticsNature Biomedical Engineering, (2022, https://doi.org/10.1038/s41551-021-00837-3).

3. Ping Song1Juwen Shen1, Dekai Ye1, Baijun Dong1… Xiaolei Zuo*, Chunhai Fan*, Programming bulk enzyme heterojunctions for biosensor development with tetrahedral DNA framework, Nature Communications, 2020, 11, 838.

4. Dekai Ye1, Min Li1, Tingting Zhai1Ping Song1…Xiaolei Zuo*, Chunhai Fan*, Encapsulating living tumor cells with hybridization chain reaction". Nature Protocols, 2020, 15(7), 2163-2185.

5. Meihua Lin, Ping Song, Guobao Zhou, Xiaolei Zuo*, Chunhai Fan*, Electrochemical detection of nucleic acids, proteins, small molecules and cells using a DNA-nanostructure-based universal biosensing platform, Nature Protocols, 2016, 11(7), 1244-1263.

6. Gabriele Romano, Pei-Ling Chen, Ping Song, … David Y Zhang, Jennifer A Wargo, Lawrence N Kwong*, A preexisting rare PIK3CAE545K subpopulation confers clinical resistance to MEK plus CDK4/6 inhibition in NRAS melanoma and is dependent on S6K1 signaling, Cancer Discovery, 2018, 8, 556-567.

7. Deepak Thirunavukarasu, Lauren Y Cheng, Ping Song, …David Yu Zhang*, Oncogene Concatenated Enriched Amplicon Nanopore Sequencing for rapid, accurate, and affordable somatic mutation detection, Genome Biology, 2021, 22, 1-17.

8. Ping Song1Dekai Ye1…. Chunhai Fan*, Xiaolei Zuo*, DNA hydrogel with aptamer-toehold-based recognition, cloaking, and decloaking of circulating tumor cells for live cell analysis, Nano Letters, 2017, 17(9), 5193-5198.

9. Ping Song …Chunhai Fan, Xiaolei Zuo*. Dynamic Modulation of DNA Hybridization Using Allosteric DNA Tetrahedral Nanostructures, Analytical Chemistry, 2016, 88, 8043-8049. 

10. Dan Zhu1Ping Song1 …Chunhai Fan*, Hao Pei*. PolyA-Mediated DNA Assembly on Gold Nanoparticles for Thermodynamically Favorable and Rapid Hybridization Analysis, Analytical Chemistry, 2016, 88, 4949-4954.

软件版权登记及专利
1. 樊春海; 左小磊; 宋萍; 一种用于肌氨酸的电化学检测方法, 2017-4-26, 中国, 2016110808061
2. 徐雪; 宋萍; 汪进平; 陈苗苗; 杨玉霞; 罗俊峰; 用于检测BRAF基因突变的引物组、试剂盒及方法, 2019-12-4, 中国, 2019112300368
3. 陈苗苗; 成昱璇; 宋萍; 徐雪; 汪进平; 罗俊峰; 用于检测EGFR基因突变的引物Blocker组、试剂盒 及方法, 2020-3-27, 中国, 2019113921252
4. 徐雪; 成昱璇; 宋萍; 汪进平; 陈苗苗; 王方金; 杨玉霞; 罗俊峰; 用于检测AML相关基因突变的引 物组、试剂盒及方法, 2020-4-10, 中国, 2019112359588
5. David Yu Zhang; Ping Song; Kerou Zhang; Amplicon comprehensive enrichment, 2020-6-26, 美国, 63/044,634.
6. David Yu Zhang; Ping Song; Xi Chen Systems and Methods for Allele Enrichment using Mult iplexed Blocker Displacement Amplification, 2019-8-29, WIPO, WO2019164885A1
7. David Yu Zhang; Deepak Thirunavukarasu; Yuxuan Cheng; Ping Song; Linear DNA assembly for nanopore sequencing, 2021-04-01, WIPO, WO2021108532A3
8. Amanda S.J. Schnepp; David Yu Zhang; Ping Song; Omid Veiseh; Siavash Parkhideh; Sudip Muk herjee; Maria Isabel Ruocco; Boram Kim; Yuxuan Cheng; High Throughput Genetic Barcoding and Anal ysis Methods, 2020-1-14, 美国, PCT/US2021/013395
9. Ping Song; Wenjun Li; David yu Zhang; Methods and Compositions for Sequencing and Fusion Detection Using Ligation Tail Adapters (LTA), 2020-12-29, 美国, PCT/US2021/064534
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