• 宋萍

    长聘教轨副教授,博士生导师,核酸生物医学工程课题组长。国家高层次人才青年计划,教育部优秀创新创业导师,上海市海外高层次人才,上海交通大学“小米学者”。博士毕业于中国科学院上海应用物理研究所,之后前往美国莱斯大学从事多年博士后和高级研究科学家的工作,与此期间兼职在NuProbe Inc (USA) 一家全球基因诊断公司担任多个大型研发课题的负责人。主要研究领域包括1)可编程核酸探针的设计及在癌症精准诊断中的应用;2)基因组和转录组的新技术开发及在癌症早期诊断和术后监测的应用;3)DNA数据存储和分子信息系统。以第一作者和通讯作者身份发表文章包括Nature ChemistryNature Biomedical Engineering (x2), Nature Communications,Nature Protocols,JACS, Angewandte Chemie International Edition (x3) 等。申请并获批多项中国、美国以及国际专利,实现多项科研成果产业化。主持和负责基金包括国家自然科学基金面上项目,科技部重点研发项目等。

    实验室网站: 

    http://nabmelab.sjtu.edu.cn/


工作经历

2016年7月-2017年7月 美国莱斯大学 博士后

2017年8月-2021年  美国莱斯大学 助理研究员

2019年1月-2021年  NuProbe Inc (USA) 高级研究科学家 (兼职)

2021年 -至今 上海交通大学生物医学工程学院

科研项目


  1. 国家自然科学基金委员会, 面上项目,  2022-01-01 至 2025-12-31, 60万元, 主持
  2. 科技部重点研发项目 2021.12 - 2024. 11 ,3000万(共),课题骨干
  3. 科技部重点研发计划 2022.11 -2025. 10 2500万(共) 主持(课题负责人)
  4. 中央高校优秀青年团队,核心成员
  5. 上海交通大学医工交叉青年项目,主持
  6. 高峰学科,青年领军科学家创新培育项目,主持


代表性论文专著

1. Zhi Weng, Jiangxue Li, Yi Wu, Xuehao Xiu, Fei Wang, Xiaolei Zuo*, Ping Song*, Chunhai Fan,* Massively Parallel Homogeneous Amplification of Chip-Scale DNA for DNA Information Storage (MPHAC-DIS), Nature Communications, 2024, Accepted

2. Hongyu Shen, Zhi Weng, Haipei Zhao, Haitao Song, Fei Wang, Chunhai Fan, Ping Song*, Random Sanitization in DNA information storage using CRISPR-Cas12a, Journal of the American Chemical Society, 2024, Accepted

3. Yi Wu,+ Jinxiao Guo, + ... Ping Song* Enhanced Detection of Novel Low-Frequency Gene Fusions via High-Yield Ligation and Multiplexed Enrichment Sequencing, Angewandte Chemie International Edition, 2024, e202316484

4. Yunpei Si+, Xiawen Wang+, Xinglei Su+...  Ping Song*Extended Enrichment for Ultrasensitive Detection of Low-Frequency Mutations by Long Blocker Displacement Amplification. Angewandte Chemie International Edition, 2024, e202400551.

5. Haipei Zhao, Xuehao Xiu ... Xiaolei Zuo*, Chunhai Fan, Zhongqun Tian, Ping Song*, Programming super DNA-enzyme molecules for on-demand enzyme activity modulation, Angewandte Chemie International Edition, 2023, e202214450.

6. Ping Song*, Chunhai Fan*. Selecting aptamers with programmed affinities. Nature Chemistry. (2023). https://doi.org/10.1038/s41557-023-01215-z

7. Ping Song+Lucia R. Wu+ … David Yu Zhang*, Limitations and opportunities of technologies for the analysis of cell-free DNA in cancer diagnostics, Nature Biomedical Engineering, 2022, 6 (3), 232-245.

8. Ping SongSherry X. Chen … David Yu Zhang*, Detection and quantitation of low fraction DNA variants via low-depth sequencing using multiplexed allele enrichment, Nature Biomedical Engineering, 2021, 5, 690-701.

9. Ping Song+Juwen Shen+, Dekai Ye+, Baijun Dong+… Xiaolei Zuo*, Chunhai Fan*, Programming bulk enzyme heterojunctions for biosensor development with tetrahedral DNA framework, Nature Communications, 2020, 11, 838.

10. Dekai Ye+, Min Li+, Tingting Zhai+Ping Song+…Xiaolei Zuo*, Chunhai Fan*, Encapsulating living tumor cells with hybridization chain reaction". Nature Protocols, 2020, 15(7), 2163-2185.

11. Meihua Lin, Ping Song, Guobao Zhou, Xiaolei Zuo*, Chunhai Fan*, Electrochemical detection of nucleic acids, proteins, small molecules and cells using a DNA-nanostructure-based universal biosensing platform, Nature Protocols, 2016, 11(7), 1244-1263.


教学工作

课程《生物化学》、《分子纳米医学工程》(致远荣誉课程、校级优秀课程)

指导学生参加全国互联网+比赛国际赛道获金奖(2022年和2023年两次)

指导学生参加中国国际大学生创新大赛获上海赛区主赛道金奖、银奖(2024年)

指导学生参加全国生物医学工程竞赛获全国三等奖(2024年)

软件版权登记及专利
1. 樊春海; 左小磊; 宋萍; 一种用于肌氨酸的电化学检测方法, 2017-4-26, 中国, 2016110808061
2. 徐雪; 宋萍; 汪进平; 陈苗苗; 杨玉霞; 罗俊峰; 用于检测BRAF基因突变的引物组、试剂盒及方法, 2019-12-4, 中国, 2019112300368
3. 陈苗苗; 成昱璇; 宋萍; 徐雪; 汪进平; 罗俊峰; 用于检测EGFR基因突变的引物Blocker组、试剂盒 及方法, 2020-3-27, 中国, 2019113921252
4. 徐雪; 成昱璇; 宋萍; 汪进平; 陈苗苗; 王方金; 杨玉霞; 罗俊峰; 用于检测AML相关基因突变的引 物组、试剂盒及方法, 2020-4-10, 中国, 2019112359588
5. David Yu Zhang; Ping Song; Kerou Zhang; Amplicon comprehensive enrichment, 2020-6-26, 美国, 63/044,634.
6. David Yu Zhang; Ping Song; Xi Chen Systems and Methods for Allele Enrichment using Mult iplexed Blocker Displacement Amplification, 2019-8-29, WIPO, WO2019164885A1
7. David Yu Zhang; Deepak Thirunavukarasu; Yuxuan Cheng; Ping Song; Linear DNA assembly for nanopore sequencing, 2021-04-01, WIPO, WO2021108532A3
8. Amanda S.J. Schnepp; David Yu Zhang; Ping Song; Omid Veiseh; Siavash Parkhideh; Sudip Muk herjee; Maria Isabel Ruocco; Boram Kim; Yuxuan Cheng; High Throughput Genetic Barcoding and Anal ysis Methods, 2020-1-14, 美国, PCT/US2021/013395
9. Ping Song; Wenjun Li; David yu Zhang; Methods and Compositions for Sequencing and Fusion Detection Using Ligation Tail Adapters (LTA), 2020-12-29, 美国, PCT/US2021/064534
联系方式

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